本所成立宗旨在於培育從事海洋事務、資源管理、生態系評估及海洋產業整合之研究，進而能研擬海洋永續管理政策與體制之高級專業人才。本所為結合海洋「自然科學」和「社會科學」跨領域研究所。所內學生個人領域和發展方向雖有不同，但均要求應修習兩大領域相關課程，以培育基本之素養。有鑑於本所研究生來自不同學校和領域，為兼顧上述基本素養之培訓，本所除要求學生必修結合科學與管理兩領域之專題討論外，並開設有「海洋資源總論」與「海洋事務總論」兩門基礎「核心必修課程」供學生修習。讓學生均具備有海洋資源與海洋事務之基本專業知識，然後在依自己的興趣與能力選擇論文研究領域。
針對2050年淨零排碳的政策，將於基礎核心課程中容物相關議題及研究供學生修習。另藉由邀請相關領域之學者、專家至所上進行專題演講，並將積極爭取多元實習管道，讓學生同時具備各領域相關知識外並能運用至未來就業上。且加強與與畢業校友之連結與合作，並提供學生實習或未來就業管道。本所教師亦積極參與USR大學社會責任之推廣，於社群上「建立海洋公共事務討論平台機制」藉由舉辦相關領域研討會，提供學者、專家進行公開討論之管道，另建立社群討論平台，針對海洋公共事務與時事開放討論空間，也增進學生與業界、專家學者互動機會。
本所積極締結國外大學姊妹研究所，打造及建立優質國際研究合作團隊。並舉辦及參與國際研討會，並持續招收外國及學生，加強與畢業外籍校友之合作，提升跨國產學與研究合作之機會。本所訂定各項學生學生英文能力、出國獎勵及補助辦法，鼓勵本所學生出國進行短期研修、實習、研究及出席國際會議，增進學生國際視野。另開設全英文授課課程，於專題討論課程中需閱讀英文論文及製作英文簡報，培養其英文素養，並依成績提供英文檢定獎學金，鼓勵學生提升英文能力。且鼓勵本所學生出國進行短期研修及出席國際會議，本所配合補助學生機票費、發表費等，降低學生經濟壓力。以及即時更新本所英文網頁平台，於社群網站更新國內外相關研究消息，培養學生英文閱讀習慣，也增進國際視野。
