2021年水產學會論文發表會於2021年1月16日於臺灣海洋大學舉行，本所碩博士生進行論文與海報發表，發表論文題目如下：
| BOI-01 | 臺灣周邊水域非法漁捕行為之類型及時空間變動 | 陳柏豪 |
| BOII-01 | 臺灣周邊水域桃紅珊瑚漁獲量與努力量之標準化 | 陳均穎 |
| BOII-03 | 台灣北部海域產鱗鰭叫姑魚(Johnius distinctus)之年齡成長研究 | 徐維品 |
| BOII-05 | 臺灣西部沿岸水域產臺灣棘鯛(Acanthopagrus taiwanensis) 之漁業生物學研究 | 楊樂達 |
| BOII-07 | 利用穩定同位素分析探討西北太平洋深海狐鮫及淺海狐鮫之攝食生態 | 呂紀嬋 |
| EO-01 | 基隆嶼海漂垃圾調查 | 李函臻 |
| EO-17 | 空拍遙測技術運用於海岸管理之調查研究:石滬為例 | 張育銘 |